人全部抓到后，大致的情况也审讯出来，朱由校召集内阁、六部、军机处等人，商量该如何处理。

毕竟这些人牵连众多，善后事宜还需要内阁六部等人处理。

等人都来到乾清宫后，朱由校将锦衣卫查出来的卷宗都给这些人轮流看了一遍。

军机处里的张维贤、熊廷弼等人之前就知道了，内阁等人只是知道个大概情况，具体的不了解。

等众人看完后，朱由校说道，“都说说，这些人该如何处置？”

“陛下，这些人和洋人勾结，背叛大明，必须处以极刑，才能震慑其他人。”内阁首辅张威说道。

“没错，对付这帮阴沟里的老鼠，就得狠一点。”军机大臣熊廷弼接着说道，作为常年坐镇边关的人，论狠角色还得是他，之前在南洋，那些土着被熊廷弼整的生不如死。

“陛下，这些人敢袭击巡防营，造成死伤二十余人，必须严厉处置，让他们知道军队不是好惹的！”

虽然巡防营由五军都督府和兵部兼管，而且职能很像后世的警察，但巡防营在大明确实是实实在在的军事单位。

对于张维贤等人来说，任何敢挑衅军队的人，都是找死。

其他人也都是建议从重处理，涉及到叛国和军队，实在没什么好说的。

“嗯，那就通知下去，孔家、孟家夷三族，原本朕是想夷九族的，不过到底是圣人之后，朕给孔夫子一个面子，改九族为三族。主要涉事的以杨家为主的十几家士绅商人也通通夷三族，其他涉事之人夷灭全家，三族之人流放离州。”

“陛下仁德！”众人连忙说道。

对于这个仁德，朱由校完全接受，本来夷九族的，改成三族，他朱由校绝对是仁慈的代名词。

“所有人全部抄家，黄金、古董字画等东西入内库，其他东西入国库。”

“是！”

“对了，那个倭国天皇一家，都给朕剥皮实草，然后放到倭国去。”

“陛下，淮王该如何安排？”瑞王问道。

“敢参与这种叛国之事，淮王一脉已经不配称为太祖子孙了。所有郡王以上者，全部处死，其余人全部废为庶人，也流放到离州，让信王好好看管。不过给他们安排个活干，总要能活下去。”