黑轩带着疲惫和伤痛的舰队返回了联盟总部。这次遭遇让他意识到，宇宙中还存在着许多未知的强大力量，联盟必须进一步加强自身的实力和防御体系。

在接下来的日子里，联盟投入了大量的资源进行军事研发和训练。同时，他们也加强了与其他星系的情报共享和合作，共同应对可能出现的威胁。

然而，就在联盟紧锣密鼓地准备时，内部却出现了一些不和谐的声音。一些人认为联盟在扩张过程中过于激进，忽视了一些星系的感受；另一些人则对资源的分配提出了质疑，认为存在不公平的现象。

黑轩深知，如果不能解决这些内部矛盾，联盟将面临分裂的危险。他再次召集了联盟的各方代表，进行了一场坦诚而深入的对话。

“我们的初衷是为了维护宇宙的和平与稳定，而不是为了权力和利益。如果我们失去了这个初心，那么联盟就失去了存在的意义。”黑轩的话语掷地有声。

经过长时间的讨论和协商，各方最终达成了妥协和共识。联盟制定了更加公平合理的政策和制度，同时也明确了未来的发展方向和目标。

就在联盟逐渐恢复稳定和团结的时候，新的危机又悄然降临。一种神秘的病毒在联盟控制的星系中传播开来，感染者会出现严重的幻觉和暴力倾向，给社会秩序带来了极大的混乱。

联盟的医疗团队迅速展开研究和救治工作，但病毒的传播速度极快，而且变异频繁，让他们感到束手无策。

“这到底是什么病毒？为什么如此难以控制？”苏瑶焦急地问道。

黑轩眉头紧锁，“不管付出多大的代价，我们都要找到解决办法，不能让病毒继续肆虐。”

经过日夜不停的努力，医疗团队终于发现了病毒的传播途径和弱点。联盟采取了一系列严格的防控措施，并研发出了特效药物，逐渐控制住了疫情。

但这场疫情也让联盟元气大伤，经济发展停滞，社会信心受到了严重打击。

黑轩望着窗外的星空，心中感慨万千。“宇宙的道路充满了坎坷，但我们不能放弃，只要我们团结一致，就一定能够迎来真正的和平与繁荣。”

在疫情得到控制之后，联盟开始着手恢复经济和重建社会秩序。然而，这个过程并不顺利。