解决了强敌，本来是一件可喜可贺的事情，可是这一战虽然胜利了，但付出的代价实在是过于惨重，NERV日本分部几乎全毁，初号机也因为再次暴走失去了战斗能力，更要命的是，因为达到了400%的同步率，碇真嗣也直接被初号机同化，消失在了驾驶舱之内。如果再加上之前零号机的自爆的话，现在整个NERV能够战斗的，也只剩下了明日香和她的二号机了。
而现在NERV要面临的，将是死海文书中记录着的最后两个使徒，也就是说，在最坏的情况下，二号机是需要以一敌二的。也多亏了使徒的行动模式就跟葫芦娃救爷爷一样是一个一个来，不然的话，这仗可真没法打了。
可能对于NERV中不明真相的打工人来说，最近唯一收到的好消息就是EVA13号机的建造也已经启动了，在他们看来，零号机、初号机的严重受损，三号机、四号机的毁灭，正是促成这一行动的主要原因。
不过知道真相的古罗很清楚，这是SEELE和碇源堂都急了，前有神秘黑影的出现，后有使徒仅剩两名的客观因素，一切的一切，都让他们急着加快人类补完计划的进行了。
不过根据墨菲定律，一向是好的不灵坏的灵，使徒的进攻并不会根据EVA的数量而改变，就在零号机初号机的维修未完成之时，新的使徒又发起来新一轮的进攻。
“嘟！嘟！全员第一战斗部署！准备对空迎击战！”
随着警报声的响起，新的使徒也出现在了大屏幕上，不过奇怪的是，这个使徒却只是安静的停留在卫星轨道上一动不动，就好像耐心的老鹰在等待着猎物露出破绽，然后好一击致命一样。
“对方是有什么企图呢？还是说目标有什么办法在不靠近我们的情况下就能发动攻击……”望着屏幕中静止不动的目标，葛城里美沉吟着：“但是目标不靠近我们的话，我们是没有办法发动攻击的啊……毕竟EVA是没有办法对卫星轨道上的目标发动攻击的啊。”
“算了，二号机出动，准备超远距离攻击，无论怎么样，我们都要试探一下对手。”百思无果后，与其在这里和对方干耗着，葛城里美还是决定先下手为强。
明日香…靠你了啊…
在零号机和初号机无法参战的情况下，二号机便成为了唯一的希望……
倾盆大雨之中，二号机抓住了弹射而起的新型阳电子炮，面对着卫星轨道上的目标，明日香苦苦修炼的武技却是派不上任何用场，无奈之下，也只能重新回归到效果并不算理想的远程攻击武器上。
将炮口对准了目标后，明日香却迟迟没有扣下扳机，毕竟就算是50米的手枪射击，枪口几毫米的偏差就能让子弹完全脱靶，更不用说这四百公里的距离了。八百里开外一枪干掉敌方目标的事情，大多数时候听听就好了。
“受不了，赶紧过来打完收工啊！”在‘目标仍在射程之外’的提示音中，明日香显得十分不耐烦，没有经过专业狙击手训练的十四岁少女，在这个时候明显没有太多的耐心。
就在明日香准备向葛城里美请示要不要抱着试试看的态度想办法先干对方一炮的时候，异变突然发生了……